DNS systemu Windows 2000 jest preferowanym systemem nazw dla systemów operacyjnych Windows 2000 zarówno w środowiskach macierzystych, jak i mieszanych. Chociaż inne implementacje systemu DNS, takie jak domena nazw internetowych Berkeley (BIND) w wersji 8.1.2, są kompatybilne z wymaganiami systemu Windows 2000, to Windows 2000 DNS jest w pełni zintegrowany z usługą Active Directory i korzysta z replikacji wielonarzędnej.
Klienty niższego poziomu, takie jak Windows NT4, korzystają z rozwiązywania nazw podstawowego sieciowego systemu wejścia/wyjścia (NetBIOS), szczególnie przy lokalizowaniu kontrolerów domeny (DC). Klienty te opierają się na emisjach i usługach nazw NetBIOS (NBNS), takich jak usługa nazw internetowych systemu Windows (WINS). Windows 2000 DNS jest przystosowany do usługi WINS i wykorzystuje integrację WINS w środowiskach mieszanych do lokalizowania usług i zasobów sieciowych. Klienty systemu Windows NT4 mogą rejestrować się w usłudze WINS systemu Windows 2000, a klienty systemu Windows 2000 mogą się rejestrować w usłudze WINS systemu Windows NT4.